PBI kdo ma v projektu File "ligand_detector.py", line 81, in <module> num = int(atoms.atom[len(atoms.atom)-1].resi) - int(atoms.atom[0].resi) + 1 #number of resn IndexError: list index out of range ?
Já tam mám ěnco podobnýho, proč? resp. jak kdo to má v projektu :D
nekdo misto komu mi lexa pise o chybach....
jo a asi to doslo vsem..
Omlouvam se za irelevantni mail. Mel jsem otevren soubor Vaseho kolegy (xkonca00@stud.fit.vutbr.cz) a neuvedomil jsem si, ze mail pujde vsem.
:-D Ondro tak už všichni víme o tvých chybách :-D
piste ty chyby tak aby vypsaly cely zdrojak... :D
:-D No to říkej Ondrovi, ten to schválně píše tak aby ty chyby vypsaly nepodstatný věci, který ostatním nepomůžou :-D :-D
staci ked Honza Herec nazdiela svoj kod :-D
Zobrazit všechny odpovědi (4)
:-D Jo to nasdílím - v příštím semestru :-D
http://www.lancerlife.com/wp-content/uploads/2015/06/keep-calm-and-accept-the-challenge-4.png
v tom rpipade pockam :-D
jj, počkej si, filipe do února :-D
Já vždycky když odchytím výjimku tak automaticky vypisuji celej zdroják, to je jasný, nevím proč Ondra jde proti zajetým konvencím :-D
Zobrazit všechny odpovědi (6)
ty hlavne komentujes kod pekne cesky s hackami a carkami, to sa pochval :-D
beztak v cp-1250 :D
:-D Tak já sám jsme velmi skromný člověk, takže se snažím nechválit :-D Ale máš pravdu - testuji možnosti UTF8 - bohužel u Zbořila asi UTF8 nefunguje :-D :D
njn dobre ze si na slabinu tvojho pristupu dosiel sam, inak by si si nedal poradit :-D ale vidis ze sme mali pravdu :-D
to mi pripomina ze musim odovzdat TAM :-D
:-D Hele filipe vsadím se že jestli v dnešní době není někde UTF8 dostupný, tak je to právě na Zbořilovém noťáku a já mě zrovna tu smůlu :-D ..hele na to fakt nezapomeň aj bych za tu aplikaci rád dostal nějaký body :-D
Tak pánové, když už se tu bavíte na můj účet, řekněte mi: Proč mě to takovou chybu nidky nevyhodilo a když spustím co sem odevzdal, tak to jede? :D :D
Zobrazit všechny odpovědi (18)
neni to treba jina verze pymol/pythonu? ma tam vubec ty data?
at ti posle https://pip.pypa.io/en/stable/reference/pip_list/
Tak data to tahá automaticky z PDB
a pokazde stejna?
j, to je přes ty kódy jejich, jak to jednou stahne, už je pak ani nestahuje znova
rekni mu at ti da server na kterym si to muzes zkusit, on takovy ma a loginy uz rozdaval
nebo se domluv ze mu to po zkousce ukazes
to tady musíš postnout celej zdroják ondro, abychom ti byli schopni kvalifikovaně poradit :-D ale asi bych mu to ukázal po zkoušce, že to u tebe funguje, je to divný no...
dalsi moznost je zeptat se ho jestli umi pouzivat python jako email.... a zapsat si to pristi rok... :D
Michal Orsák :-D :-D To bych neprovokoval s tou otázkou - to ani za rok nezapomene :-D
Honza Herec not my style.... :)
Michal Orsák jj, s takovým stylem už bys v 5. ročníku asi nebyl :-D
To mi pripomina, ze bych se mel ucit... a dodelat projekty....
Michal Orsák no učit na PBI se začínám zítra odpoledne někdy a musím dodělat THE, ale to nevím, je docela možný že to někdy v průběhu ledna dokončím...
Já budu u zkoušky asi spoléhat na svoji Bioinformatickou intuici, kterou jsem, snad, za poslední rok nabral... :D
Intuice je dobrá věc a zkoušky s tím počítají (takže smůla) :-D
Beru to tak, že není minimum a odevzdal sem projekt (který jak zjišťuji nejde spustit, takže to asi na tu intuici nepůjde jak říkáš no :D )
:-D Hele pokud mu to vysvětlíš po zkoušce, tak ti snad body připíše, tolik času ses s tím drbal, to se nenech odrat zase :-D Ale minimum není, to je dobré :-)
PBI Je tu este niekto kto mal tento predmet minuly rok? Chcel by som sa opytat 2 otazky :)
A nebylo by efektivnější ty dvě otázky postnout rovnou sem, místo vytváření zbytečného mezikroku pro Tebe i potenciálního odpovídajícího? :)
PBI Je tu este niekto kto mal tento predmet minuly rok? Chcel by som sa opytat 2 otazky :)
PBI muzu se zeptat tech, co uz tu zkousku udelali, z ceho se na to ucili? prezentace k prednaskam jsou pomerne dost chaoticke.
víceméně starý zadání + google. K některejm otázkám se v těch slidech něco málo zjistit dá, ale je to doopravdy hodně bídný.
PBI Robi / bude robit niekto projekt? Mal by som par otazok ak ano.
PBI Niekto nejaky hint ako to spravit alebo aspon kde zacat ? :D
za spravnost nerucim, sam jsem to jen odhadoval. a) najit si gen a pak jeho rodinu treba tady http://www.genenames.org/ b) nejak vytvorit ten .gff3 soubor pomoci ruznych db, ja treba bral souradnice genu z ENSEMBL. c) stahnout si dna vybranych genu a ty ready z toho experimentu SRR4432886. d) oboje namapovat na sebe pomoci bowtie/bowtie2 e) skrz samtools prevest .sam z d) na .bam
Ako si zistil TATAWAA ?